Обновленная версия рекомендаций содержит раздел о порядке проведения вакцинации детей с различными заболеваниями. При решении вопроса об иммунизации детей с первичным иммунодефицитом не требуется дополнительных исследований иммунного статуса, так как диагноз уже верифицирован. Кроме того, органические поражения нервной системы у детей не являются противопоказанием к вакцинации, а детям старше 12 лет из группы высокого риска тяжелого и осложненного течения COVID-19 следует проходить вакцинацию в приоритетном порядке.
В ноябре 2021 года была зарегистрирована вакцина Спутник М, предназначенная для иммунизации детей 12—17 лет. В декабре вакцинация этой возрастной группы вошла в календарь профилактических прививок по эпидемическим показаниям. В январе 2022 года Минздрав одобрил проведение клинических исследований Спутника М с участием детей в возрасте от 6 до 11 лет.