Авторы статьи проследили, как в первые четыре месяца жизни формируется кишечная микробиота при грудном и искусственном вскармливании, причем дети на искусственном вскармливании получали смесь с пребиотиками и 2’-фукозиллактозой – одним из наиболее распространенных олигосахаридов грудного молока. Микробные сообщества двух групп развивались по разным траекториям и не становились идентичными, однако обогащенная смесь поддерживала выраженную колонизацию Bifidobacterium и по ряду характеристик сдвигала развитие микробиоты в сторону профиля, характерного для грудного вскармливания. Работа заодно показывает, почему при интерпретации анализа микробиоты недостаточно разделять бактерии на «хорошие» и «плохие»: значение имеют их сочетания, обмен метаболитами, способ родоразрешения и весь контекст первых месяцев жизни.
- зачем в грудном молоке нужны углеводы, которые практически не перевариваются самим младенцем;
- как олигосахариды грудного молока направляют раннее формирование кишечной микробиоты и почему особенно важны бифидобактерии;
- чем траектории созревания микробиоты при грудном и искусственном вскармливании отличаются уже в первые месяцы жизни;
- какую роль играет 2’-фукозиллактоза и почему смесь с 2’-FL и пребиотиками способна поддерживать бифидогенный профиль микробиоты;
- почему воздействие ОГМ не ограничивается «подкармливанием» отдельных бактерий, а затрагивает целые цепочки межмикробных взаимодействий;
- что происходит с Bifidobacteriaceae к четырем месяцам жизни при разных типах вскармливания;
- почему обнаружение Staphylococcus aureus или Clostridium perfringens у младенца само по себе еще не означает патологию;
- как способ родоразрешения может менять микробный профиль и мешать слишком прямолинейно связывать все различия только с типом питания;
- в какой степени современные компоненты молочных смесей позволяют приблизить развитие микробиоты к естественной траектории – и почему речь все же идет именно о приближении, а не о полном воспроизведении эффектов грудного молока.
В.Е. Одинцова3, И.Н. Захарова1, Д.В. Макаркин4
Резюме
Введение. Формирование кишечной микробиоты в раннем постнатальном периоде является важным этапом онтогенеза, во многом определяющим последующее метаболическое и иммунное развитие ребенка. Олигосахариды, поступающие с грудным молоком и обладающие пребиотическими и иммуномодулирующими свойствами, играют существенную роль в формировании микробного сообщества.
Цель. Оценить формирование таксономического состава кишечной микробиоты у детей первых месяцев жизни на грудном и искусственном вскармливании и интерпретировать особенности ее метаболического потенциала с позиции биологической роли олигосахаридов грудного молока.
Материалы и методы. Проведено проспективное продольное неинтервенционное когортное исследование в параллельных группах. В исследование включены 90 детей: 45 находились на грудном вскармливании, 45 – на искусственном и получали смесь, обогащенную пребиотиками, галактоолигосахаридами и 2’-фукозиллактозой. Наблюдение осуществляли на 30 ± 2, 60 ± 2 и 120 ± 2-й день жизни. Микробиологическое исследование образцов кала проводили на первом и третьем визитах. После контроля качества в окончательный анализ вошли 126 образцов от 64 детей, из них 34 ребенка находились на грудном вскармливании, 30 – на искусственном. Для выявления таксонов, определяющих межгрупповые различия, использовали метод LEfSe.
Результаты. Установлено, что как на 30-й день жизни, так и к возрасту 4 мес. между группами сохранялись отдельные статистически значимые различия в составе кишечной микробиоты. Полученные данные подтверждают, что грудное вскармливание является одним из ключевых факторов раннего становления кишечной микробиоты. При его отсутствии траектории микробной колонизации, таксономическая структура и характер межвидовых взаимодействий в микробном сообществе претерпевают изменения. Тем не менее включение пребиотических компонентов в состав детской смеси служит ключевым фактором стимуляции роста Bifidobacterium. Это позволяет скорректировать вектор развития микробиоты кишечника, приближая его к показателям детей на естественном вскармливании.
Выводы. Таким образом, тип вскармливания оказывает значимое влияние на раннее формирование кишечной микробиоты. Смесь, обогащенная 2’-фукозиллактозой, способствует колонизации кишечника представителями рода Bifidobacterium, увеличение доли которых у детей на искусственном вскармливании может рассматриваться как адаптационный защитный механизм формирующейся микробиоты в условиях отсутствия грудного молока.
Ключевые слова: олигосахариды грудного молока, грудное вскармливание, искусственное вскармливание, кишечная микробиота, 2’-фукозиллактоза, младенцы, Bifidobacterium, Clostridium perfringens
Для цитирования: Оробинская ЯВ, Сугян НГ, Кошечкин СИ, Одинцова ВЕ, Захарова ИН, Макаркин ДВ. Олигосахариды грудного молока как фактор формирования дифференцированных микробиологических профилей кишечной микробиоты детей первых месяцев жизни. Медицинский совет. 2026;20(11):21–30. https://doi.org/10.21518/ms2026-270.
Конфликт интересов: авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
English version / Abstract & Authors
Human milk oligosaccharides as a factor in the formation of differentiated microbiological profiles of the gut microbiota in infants during the first months of life
Yana V. Orobinskaya1, Narine G. Sugian1,2, Stanislav I. Koshechkin3,
Vera E. Odintsova3, Irina N. Zakharova1, Dmitriy V. Makarkin4
1 Russian Medical Academy of Continuous Professional Education; 2/1, Bldg. 1, Barrikadnaya St., Moscow, 125993, Russia
2 Khimki Clinical Hospital; 11, Kurkinskoe Shosse, Khimki, Moscow Region, 141407, Russia
3 Nobias Technologies LLC; 14b, Room 2/4, Bldg. 2, Beryozovaya Alleya St., Moscow, 127273, Russia
4 PROGRESS JSC; Estate 2, Angarskaya St., Lipetsk, 398902, Russia
Abstract
Introduction. During the early postnanal life, gut microbiota establishment is an important stage of ontogenesis, which plays a key role in the development and maturation of the child's metabolic and immune systems. Oligosaccharides, which reach a child’s body with the breast milk and have prebiotic and immunomodulatory properties, are critical regulators in the formation of the microbial community.
Aim. To assess taxonomic development of the gut microbiota in breastfed and formula-fed infants in the first months of life and interpret the characteristics of its metabolic potential from the perspective of the biological role of breast milk oligosaccharides.
Materials and methods. We conducted a prospective, longitudinal, non-interventional, parallel-group cohort study. The study included 90 infants: 45 were breastfed, 45 were formula-fed, receiving a probiotic-containing infant formula supplemented with galactooligosaccharides, and 2'-fucosyllactose. The infants were observed on 30 ± 2, 60 ± 2, and 120 ± 2 days of age. Microbiological tests of stool samples were performed at Visits 1 and 3. After quality control, 126 samples from 64 infants were included in the final test, of which 34 were from breastfed infants and 30 from formula-fed infants. The LEfSe method was employed to identify significantly discriminative taxa between groups.
Results. It was found that some statistically significant differences in the composition of the intestinal microbiota were stable between the groups both at 30 days and 4 months of age. These findings confirm that breastfeeding is a key factor for the early establishment of the intestinal microbiota. In its absence, the microbial colonization trajectories, the taxonomic structure, and the nature of interspecies interactions in microbial communities undergo changes. However, the inclusion of prebiotic components in infant formula is a key growth factor for Bifidobacterium. This helps to adjust the trend of development of the gut microbiota, bringing it closer to the breastfed infants’ indicators.
Conclusions. As can be seen from the above, feeding type has a marked impact on the early development of the gut microbiota. A formula enriched with 2'-fucosyllactose promotes intestinal colonization by the bacterial genus Bifidobacterium. The increased proportion of these bacteria in formula-fed infants may be considered as an adaptive protective mechanism of the development of microbiota in the absence of breast milk.
Keywords: human milk oligosaccharides, breastfeeding, formula feeding, intestinal microbiota, 2'-fucosyllactose, infants, Bifidobacterium, Clostridium perfringens
For citation: Orobinskaya YaV, Sugian NG, Koshechkin SI, Odintsova VE, Zakharova IN, Makarkin DV. Human milk oligosaccharides as a factor in the formation of gut microbiota profiles in infants during the first months of life. Meditsinskiy Sovet. 2026;20(11):21–30. (In Russ.) https://doi.org/10.21518/ms2026-270.
Conflict of interest: the authors declare no conflict of interest.
Введение
В последние годы процесс колонизации кишечника младенцев рассматривается как одно из приоритетных направлений исследований в области педиатрии и здравоохранения. Особое значение придается первым 1000 дням жизни, в течение которых происходит становление кишечного микробиома и закладываются основы его дальнейшего функционирования. В этот период микробное сообщество претерпевает выраженные изменения, связанные как с постнатальной адаптацией организма, так и с переходом от молочного типа питания к более разнообразному рациону [1]. Микробиом кишечника в раннем возрасте характеризуется высокой динамичностью и относительной нестабильностью. В течение первых лет жизни его таксономический состав и функциональный потенциал постепенно изменяются, и уже к подростковому возрасту микробное сообщество достигает наибольшей стабильности и в последующем сохраняет сравнительно постоянную структуру во взрослом возрасте. Это позволяет рассматривать раннюю кишечную колонизацию как важнейший этап онтогенеза, определяющий направление дальнейшего развития микробиоты [2].
Одним из ключевых факторов, влияющих на формирование кишечного микробиома младенца, является грудное вскармливание (ГВ). Его значение определяется не только обеспечением физиологических потребностей ребенка в макрои микронутриентах, но и поступлением широкого спектра биологически активных компонентов, оказывающих влияние на микробную колонизацию, иммунную защиту и созревание кишечного барьера. Доказано, что преимущества исключительно ГВ имеют положительное влияние не только в период младенчества, но и сохраняются в более позднем возрасте [3].
Грудное молоко (ГМ) представляет собой сложную биологическую систему, включающую иммуноглобулины, лактоферрин, цитокины, микроорганизмы и олигосахариды грудного молока (ОГМ), которые в совокупности формируют условия для становления благоприятного микробного профиля кишечника [4].
Среди множества этих компонентов особый интерес представляют именно ОГМ, также известные как гликаны грудного молока, представляющие собой короткие полимеры простых сахаров. По содержанию в зрелом грудном молоке они занимают третье место после лактозы и липидов: их концентрация составляет до 20–25 г/л в молозиве и 5–15 г/л в зрелом молоке [5]. В отличие от большинства пищевых углеводов ОГМ практически не расщепляются ферментами желудочно-кишечного тракта (ЖКТ) младенца и достигают дистальных отделов кишечника в неизмененном виде. Там они становятся субстратом для ограниченного круга микроорганизмов, обладающих способностью для их утилизации. К числу таких микроорганизмов прежде всего относятся представители рода Bifidobacterium, включая Bifidobacterium longum subsp. infantis, Bifidobacterium longum subsp longum, Bifidobacterium breve и отдельные штаммы Bifidobacterium bifidum. Благодаря этому ОГМ способствуют раннему поэтапному развитию микробиоты [6]. Функциональная роль ОГМ не ограничивается их пребиотическим эффектом. Эти соединения выполняют антиадгезивную функцию, поскольку по своей структуре сходны с гликановыми рецепторами поверхности эпителиоцитов и способны связывать патогенные и условно-патогенные микроорганизмы, препятствуя их прикреплению к слизистой оболочке кишечника. Кроме того, они участвуют в регуляции иммунного ответа, способствуют созреванию эпителиального барьера, модулируют воспалительные реакции и поддерживают формирование иммунологической толерантности. В связи с этим ОГМ следует рассматривать не только как питательный компонент, но и как один из ключевых регуляторов ранней кишечной микробиоты [7].
Обогащение современных молочных смесей пребиотическими компонентами является высокоэффективной стратегией модуляции кишечной микробиоты у детей на ИВ. Несмотря на природную гетерогенность олигосахаридов грудного молока (более 200 вариантов), включение в адаптированные смеси научно обоснованного комплекса пребиотиков галактоолигосахаридов (ГОС), фруктоолигосахаридов (ФОС) и передового компонента 2’-фукозиллактозы (2’FL) позволяет успешно скорректировать траекторию микробной колонизации. Данная комбинация избирательно поддерживает доминирование рода Bifidobacterium, оптимизирует функционально-метаболический потенциал сообщества и предотвращает преждевременную экспансию зрелых анаэробных таксонов, приближая вектор развития микробиоты к показателям детей на грудном вскармливании [8–10].
Цель – оценить формирование таксономического состава кишечной микробиоты у детей первых месяцев жизни на грудном и искусственном вскармливании и интерпретировать особенности ее метаболического потенциала с позиции биологической роли олигосахаридов грудного молока.
Материалы и методы
Настоящая работа выполнена в рамках проспективного продольного неинтервенционного когортного исследования в параллельных группах. Исследование проводилось на базе кафедры педиатрии имени Г.Н. Сперанского ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации и ГБУЗ Московской области «Химкинская клиническая больница» в период с декабря 2023 г. по сентябрь 2025 г. В соответствии с протоколом исследования обследование проводилось в динамике с выполнением контрольных визитов на 30 ± 2 день жизни, 60 ± 2 день жизни и 120 ± 2 день жизни. Младенцы были распределены на группы в зависимости от вида вскармливания. Сформированы две сопоставимые группы: первую группу составили дети, находившиеся на ГВ (n = 45), вторую – дети, находившиеся на ИВ и получавшие детскую молочную смесь, обогащенную пребиотиками (ГОС 1,54 г на 100 г сухого продукта) и содержащую олигосахарид грудного молока (2’-FL 0,156 на 100 г сухого продукта) (n = 45). Таким образом, общее количество детей, включенных в исследование на исходном этапе, составило 90 человек. Расчет суточного объема питания у детей, находившихся на искусственном вскармливании, осуществлялся индивидуально с учетом возраста и массы тела ребенка с использованием калорийного метода.
Клиническое наблюдение за детьми проводилось в течение первых четырех месяцев жизни. На каждом этапе оценивались общее состояние ребенка, характер вскармливания, а также наличие факторов, потенциально способных оказать влияние на формирование кишечной микробиоты. Образцы биологического материала (образцы кала) отбирались дважды – во время первого и третьего визитов. Полученный материал использовался для последующего анализа качественного и количественного состава кишечной микробиоты, а также для оценки ее динамики в зависимости от типа вскармливания.
Всего контроль качества этапов сбора материала и пробоподготовки прошли 165 образцов. После проведения контроля качества секвенирования в дальнейший анализ были допущены 163 образца. Для изучения динамики кишечной микробиоты были отобраны образцы от детей, у которых одновременно соблюдались следующие условия: оба образца кала, полученные на первом и третьем визитах, успешно прошли контроль качества, а в период наблюдения отсутствовали нежелательные явления, не связанные с типом вскармливания и потенциально способные повлиять на состав кишечной микробиоты, в частности острые респираторные вирусные инфекции. Указанным критериям соответствовали 126 образцов, полученные от 64 детей. В окончательный анализ были включены 34 ребенка, находившихся на грудном вскармливании, и 30 детей, находившихся на искусственном вскармливании. С учетом способа родоразрешения в окончательной выборке 9 детей родились путем кесарева сечения, 55 детей – через естественные родовые пути.
Исследование кишечной микробиоты проводилось на основании анализа образцов кала, полученных на запланированных этапах наблюдения. Для оценки различий в микробном составе между исследуемыми группами выполнялся анализ дифференциальной представленности бактериальных таксонов на каждом визите наблюдения. С целью определения микроорганизмов, в наибольшей степени обусловливающих межгрупповые различия в структуре микробного сообщества, применялся метод NearestBalance. Этот подход позволяет учесть относительную природу данных, т. е. то, что секвенирование позволяет оценить только относительные представленности бактерий, а не их абсолютное количество. С его помощью среди всех бактерий были выделены две группы, баланс между которыми сильнее всего связан с типом вскармливания.
Исследование выполнено в соответствии с принципами биомедицинской этики, действующими нормативными требованиями и утвержденным протоколом исследования. Протокол исследования был одобрен Локальным этическим комитетом Департамента здравоохранения города Москвы ФГБОУ ДПО «Российская медицинская академия непрерывного профессионального образования» Министерства здравоохранения Российской Федерации, протокол №12 от 10.10.2023 г.
Результаты и обсуждение
Микробиом человека и его организм следует рассматривать как сформировавшуюся в результате коэволюции, взаимной адаптации и функциональной интеграции на протяжении сотен тысяч лет единую систему. ЖКТ человека заселен богатым и разнообразным микробным сообществом, формирование которого начинается сразу после рождения и продолжается в течение всей жизни. В ранее проведенном исследовании было показано, что ГВ ассоциировано с меньшим микробным разнообразием кишечника у младенцев [11]. Также известно, что кишечник новорожденных в значительной степени заселяется микроорганизмами, способными утилизировать ОГМ, в т. ч. представителями рода Bacteroides. Это позволяет предположить, что состояние кишечного микробиома в раннем неонатальном периоде может определяться не столько общим бактериальным разнообразием, сколько преобладанием отдельных таксонов, адаптированных к использованию компонентов ГМ, в частности Bacteroides и Bifidobacterium. Однако данное положение требует дальнейшего изучения [12].
Результаты нашего исследования при первом визите показали различия в представленности ряда бактериальных видов между группами детей, находившихся на грудном и искусственном вскармливании (рис. 1).
Рисунок 1. Бактерии, которые вносят основной вклад в различия между группами на 1-м визите
Figure 1. Bacteria contributing the most to differences between groups at Visit 1

У детей, находившихся на ИВ, более высокими значениями характеризовались Escherichia coli, Enterococcus faecalis, Veillonella parvula, Bifidobacterium longum, Flavonifactor plautii и Bacteroides uniformis. На данном этапе наибольший вклад в микробный профиль группы ИВ вносили Escherichia coli и Enterococcus faecalis, что может свидетельствовать о более выраженном представительстве факультативно-анаэробных микроорганизмов и ранних колонизаторов кишечника у детей на ИВ, получающих искусственные смеси к первому месяцу жизни. В ранее опубликованных исследованиях также сообщалось о большем видовом богатстве и разнообразии кишечной микробиоты, а также о тенденции к увеличению ее бактериального разнообразия у младенцев, которых кормили из бутылочки [13]. Примечательно, что даже частичное введение прикорма может приводить к формированию у детей на ГВ такого состава кишечной микробиоты, который в большей степени приближается к профилю детей, находящихся на ИВ [14]. По литературным данным, кишечная микробиота детей, находящихся на ИВ, как правило, характеризуется более высоким разнообразием, большей представленностью факультативных анаэробов и более широким спектром таксонов, включая Escherichia coli, Clostridium difficile, Bacteroides и Prevotella. Установлено, что Escherichia coli (E. сoli) участвует в антибактериальной защите за счет продукции колицинов – бактериоцинов белковой природы, способных подавлять рост близкородственных бактериальных штаммов, снижая конкуренцию за питательные субстраты и экологические ниши. Это дает понять, что присутствие комменсальных штаммов E. coli в составе кишечной микробиоты младенцев может рассматриваться как один из факторов колонизационной резистентности, способствующий ограничению избыточного роста потенциально нежелательных микроорганизмов. E. coli в большинстве случае – типичный представитель кишечной микробиоты, следовательно, ее ранняя колонизация необязательно имеет патологическое значение, а, напротив, может быть связана с формированием стабильного микробного сообщества и становлением защитных функций микробиоты [15, 16].
В группе ГВ на первом визите относительно более высокая представленность была отмечена для Haemophilus parainfluenzae. Несмотря на то что в предыдущих исследованиях не была установлена связь между присутствием Haemophilus influenzae в кишечном микробиоме и развитием респираторных инфекций, показано, что представители данного рода могут колонизировать кишечный тракт без проявлений патогенного потенциала [17, 18]. Другой, особый интерес вызывают представители рода Staphylococcus, в частности Staphylococcus hominis и Staphylococcus aureus (S. аureus). По данным литературы, отдельные штаммы S. аureus способны персистировать в кишечной микробиоте младенцев в течение нескольких месяцев, при этом их содержание в образцах кала может оставаться достаточно высоким. Установлено, что около половины штаммов S. аureus, выделенных из кишечной микрофлоры младенцев, являются токсин-продуцирующими, однако, по-видимому, это не сопровождается неблагоприятным влиянием на состояние здоровья детей [19]. Полученные данные могут косвенно свидетельствовать о протективной роли ОГМ в поддержании микробного гомеостаза кишечника. В частности, S. аureus способен переходить от состояния комменсального колонизатора к инфекционному патогену, что определяется характером взаимодействия между кишечным барьером, иммунными клетками, составом микробиоты и степенью сохранности кишечной стенки [20]. В исследовании S. Jepsen показано, что отдельные структуры гликозилированных соединений способны существенно модифицировать активацию, дифференцировку и функциональное состояние макрофагов, полученных из моноцитов, в ответ на воздействие S. аureus. Наиболее выраженный эффект продемонстрировала 6’-сиаллилактоза (6’-SL): ее действие сопровождалось изменением экспрессии поверхностных маркеров макрофагов, что соответствовало формированию активированного М1-подобного фенотипа. Кроме того, при совместном воздействии 6’-SL и S. aureus по сравнению с изолированным воздействием S. аureus отмечалось повышение продукции провоспалительных цитокинов ФНО-α, IL-6, IL-8, IFN-γ и IL-1β. Также макрофаги, обработанные 6’-SL, характеризовались изменением пролиферативной активности и повышенной экспрессией ключевого транскрипционного фактора, ассоциированного с М1-поляризацией. В совокупности эти результаты свидетельствуют о том, что отдельные компоненты ГМ способны усиливать иммунный ответ на S. аureus, не индуцируя воспалительную реакцию в отсутствие самого патогена. Это позволяет предположить их значимую роль в поддержании противоинфекционной защиты в раннем младенческом возрасте [21]. Согласно данным исследования Erika Lindberg, основным источником штаммов S. аureus, выявляемых у новорожденных, преимущественно является кожная микрофлора родителей. Установлено, что 90% штаммов S. аureus, обнаруженных в кале младенцев на 3-и сут. жизни, и 75% штаммов, выявленных у детей в возрасте до 1 мес., были идентичны штаммам, присутствовавшим на коже родителей через 3 дня после родов. Авторы также показали, что S. аureus выявлялся на сосках матери почти так же часто, как и в ее носовых ходах (22 и 30% соответственно). Примечательно, что у ребенка, рожденного путем кесарева сечения, уже на третьи сутки жизни в фекалиях был обнаружен S. аureus, идентичный штамму, выделенному с сосков матери [22]. В этом аспекте важную роль играет контакт «кожа к коже» в первый час после рождения, или т. н. золотой час. Его реализация способствует раннему прикладыванию к груди, становлению лактации, а также первичной микробной инокуляции новорожденного материнскими микроорганизмами [23]. Следует отметить, наибольшая частота носительства S. аureus выявлялась у младенцев в возрасте от 29 дней до 6 мес. и составляла 13,86%. Считается, что это связано с функциональной незрелостью иммунной системы и, как следствие, с более высокой восприимчивостью младенцев к колонизации S. аureus [24]. Эти результаты согласуются с данными других исследований, согласно которым частота носительства S. аureus у детей максимальна в первые 6 мес. жизни и в дальнейшем постепенно снижается с возрастом. Имеются также сведения о возможности передачи метициллин-резистентного Staphylococcus aureus от матери ребенку при ГВ. Вместе с тем бактерии, присутствующие в ГМ, включая Lactobacillus и S. aureus, могут участвовать в формировании иммунной системы ребенка [25, 26]. Следует подчеркнуть, что кишечная колонизация S. аureus чаще наблюдается у детей, находящихся на ГВ, по сравнению с детьми, получающими ИВ, что согласуется и с результатами нашего исследования: у детей на ИВ S. аureus не выявлялся (рис. 2) [27].
Рисунок 2. Распространенность Staphylococcus aureus на 1-м и 3-м визите в зависимости от типа вскармливания
Figure 2. Prevalence of Staphylococcus aureus at Visits 1 and 3 depending on feeding type

Анализ распространенности Staphylococcus aureus на первом визите продемонстрировал статистически значимые межгрупповые различия с противоположной направленностью. В группе ГВ данный микроорганизм выявлялся у 20,6% детей (95% ДИ: 10,3–36,8), при этом в группе ИВ он не был обнаружен ни в одном из исследованных образцов (0%; 95% ДИ: 0–11,4, p = 0,0119, p.adj = 0,0476; табл. 1).
Table 1. The incidence of Staphylococcus aureus detected in samples of infants in different groups at different follow-up stages
| Визит | Грудное вскармливание | Искусственное вскармливание | p | p.adj | ||
|---|---|---|---|---|---|---|
| Не выявлен, % [95% ДИ] | Выявлен, % [95% ДИ] | Не выявлен, % [95% ДИ] | Выявлен, % [95% ДИ] | |||
| 1 | 79,4 [63,2; 89,7] | 20,6 [10,3; 36,8] | 100 [88,6; 100] | 0 [0; 11,4] | 0,0119 | 0,0476 |
| 3 | 94,1 [80,9; 98,4] | 5,9 [1,6; 19,1] | 100 [88,6; 100] | 0 [0; 11,4] | 0,494 | 0,5646 |
Поэтому выявление кожно-ассоциированных стафилококков у детей на ГВ может рассматриваться не как изолированный микробиологический феномен, а как часть физиологического континуума, включающего ранний контакт матери и ребенка, успешное начало грудного вскармливания и его продолжительности и последующую передачу материнской микробиоты через кожу и ГМ, в то же время отсутствие Staphylococcus aureus у детей на ИВ можно рассматривать в качестве положительного маркера в условиях ограниченного количества защитных факторов питания по сравнению с ГВ.
Выявление Veillonella ratti и Veillonella dispar (V. dispar) среди таксонов, ассоциированных с ГВ, имеет не только таксономическое, но и функциональное значение. Представители рода Veillonella, включая V. dispar, относятся к числу типичных обитателей кишечника и ротовой полости младенцев. Показано, что они могут поступать в организм ребенка с ГМ, входить в состав микробиома ГМ и участвовать в становлении кишечной микробиоты, в частности в утилизации промежуточных продуктов бактериальной ферментации [28]. Представители рода Veillonella являются грамотрицательными облигатными анаэробами, использующими лактат в качестве основного энергетического субстрата. Их присутствие и относительная численность тесно связаны с активностью лактат-продуцирующих микроорганизмов, прежде всего Bifidobacterium и Streptococcus. При ГВ ОГМ селективно стимулируют рост Bifidobacterium, которые в процессе ферментации этих гликанов образуют ацетат и лактат. Последний, в свою очередь, служит субстратом для лактат-утилизирующих бактерий, включая Veillonella. Таким образом, уже в первый месяц жизни у детей, находящихся на ГВ, можно предполагать формирование ранних трофических цепей, в которых ОГМ выступают первичным субстратом для Bifidobacterium, а продукты их метаболизма поддерживают рост других комменсальных анаэробов. Подобная метаболическая организация свидетельствует о постепенном созревании микробного сообщества и формировании функциональных взаимодействий между его участниками. Одной из основных форм такого взаимодействия является перекрестное питание метаболитами [29]. При данном типе межмикробных отношений один микроорганизм-продуцент выделяет метаболиты, которые затем используются другим микроорганизмом-консументом. Кросс-метаболизм обеспечивает более эффективное использование доступных питательных веществ в общей среде и расширяет метаболические ниши, доступные взаимодействующим бактериям [30]. Вместе с тем, по данным исследования K. Fehr et al., данный потенциально благоприятный эффект может снижаться в случаях, когда ребенок получает сцеженное грудное молоко [31]. Что касается ИВ, в наших результатах среди ассоциированных с данным типом питания таксонов преобладала только Veillonella parvula. Полученные данные частично согласуются с результатами исследования F. Guaraldi et al., согласно которым даже незначительное добавление молочной смеси к ГМ сопровождается сдвигом микробиоты в направлении, характерном для ИВ, для которого типично большее таксономическое разнообразие [32]. В частности, при таком типе питания увеличивается представленность Clostridium, Streptococcus, Bacillus subtilis, Bacteroides vulgatus и Veillonella parvula [32].
Обнаружение Clostridium perfringens представляет интерес в контексте анализа факторов, влияющих на становление ранней кишечной микробиоты. Полученные в нашем исследовании данные свидетельствуют о том, что способ родоразрешения может оказывать влияние на особенности ранней колонизации кишечника новорожденных данным микроорганизмом (рис. 3).
Рисунок 3. Распространенность Clostridium perfringens у детей, рожденных естественным путем и путем кесарева сечения
Figure 3. The prevalence of Clostridium perfringens in caesarean-born infants compared to vaginally-born infants

В настоящем исследовании частота выявления данного микроорганизма у детей первого месяца жизни была выше в группе, рожденной путем кесарева сечения (КС), по сравнению с детьми, рожденными через естественные родовые пути (ЕР): 55,6% против 27,3% соответственно. Одновременно отсутствие Clostridium perfringens чаще регистрировалось у детей после ЕР (72,7%) по сравнению с детьми после КС (44,4%). Несмотря на отсутствие статистически значимых различий (p = 0,124; p.adj = 0,496), выявленная тенденция представляет клиническую значимость. Она согласуется с современными представлениями о том, что у детей, рожденных путем КС, процесс первичного микробного заселения кишечника отличается от такового у детей после ЕР [33]. При вагинальном родоразрешении новорожденный контактирует с материнской вагинальной микробиотой, что способствует более физиологичному формированию раннего микробиоценоза. В случае КС этот путь передачи микроорганизмов ограничен, в результате чего состав микробиоты может смещаться в сторону бактерий, ассоциированных с окружающей средой, госпитальной флорой и условно-патогенными таксонами [34]. Таким образом, результаты исследования позволяют предположить, что КС ассоциировано с тенденцией к более частому выявлению Clostridium perfringens в кишечной микробиоте детей первого месяца жизни, что согласуется с результатами других научных обзоров (табл. 2) [35–37].
Table 2. Characteristics of the examined children and the incidence of Clostridium perfringens depending on the mode of delivery
| Раздел | Показатель | Естественные роды | Кесарево сечение | Всего | p | p.adj |
|---|---|---|---|---|---|---|
|
Частота выявления Clostridium perfringens |
Не выявлен | 40/55–72,7% [59,8; 82,7] | 4/9–44,4% [18,9; 73,3] | 44/64–68,8% | 0,124 | 0,496 |
| Выявлен | 15/55–27,3% [17,3; 40,2] | 5/9–55,6% [26,7; 81,1] | 20/64–31,3% |
По мере взросления младенцев уже к третьему визиту в группе ГВ в качестве наиболее характерных таксонов определялись Bifidobacterium bifidum (B. bifidum), Veillonella ratti, Clostridium perfringens, Haemophilus parainfluenzae, Lacticaseibacillus paracasei, Bifidobacterium breve и Veillonella dispar. При этом наибольший вклад в различия между группами вносили B. bifidum и Veillonella ratti, что подчеркивает сохранение специфического микробного профиля, ассоциированного с ГВ (рис. 4).
Рисунок 4. Бактерии, которые вносят основной вклад в различия между группами на 3-м визите
Figure 4. Bacteria contributing the most to differences between groups at Visit 3

Представленность Bifidobacterium bifidum уже на первом визите в группе ГВ, а также увеличение ее относительного содержания и сохранение в составе доминирующей ассоциации к третьему визиту свидетельствуют о быстром заселении кишечника младенцев Bifidobacterium в первые недели жизни и их последующем прогрессирующем нарастании. Вероятно, этому в значительной степени способствуют бифидогенные свойства ОГМ. Особое значение придается 2’-FL, наиболее распространенному ОГМ, который играет важную роль в становлении кишечной микробиоты и иммунной системы младенцев [38]. Вместе с тем механизмы, посредством которых ОГМ реализуют благоприятное влияние на здоровье ребенка через модуляцию кишечного микробиома, остаются изученными не в полной мере. Экспериментальные данные подтверждают значимость 2’-FL в регуляции микробного сообщества кишечника. Показано, что у взрослых мышей, получавших 2’-FL, возрастало содержание таксонов, ассоциированных с благоприятным состоянием кишечной экосистемы, в т. ч. представителей родов Bifidobacterium и Lactobacillus; при этом микробиота, модифицированная под влиянием 2’-FL, также оказывала защитный эффект в отношении колита [39]. С использованием Bifidobacterium infantis как модели бактерии, утилизирующей 2’-FL, были идентифицированы секретируемые метаболиты, включая пантотеновую кислоту, которая способствовала защите кишечного барьера от окислительного стресса и сопровождалась уменьшением выраженности воспалительных изменений [39]. Кроме того, анализ метаболических путей показал, что ряд нарушений, характерных для фекальной микробиоты пациентов с язвенным колитом, частично восстанавливался на фоне применения 2’-FL в экспериментальной модели [39].
Полученные нами результаты согласуются и с данными метагеномных исследований, согласно которым в раннем возрасте в составе микробиоты выявляется высокая представленность ограниченного числа видов Bifidobacterium, прежде всего B. breve, с последующим увеличением доли таксонов, характерных для более зрелого микробиома, таких как B. longum и B. adolescentis [40]. Это наблюдение представляется важным и в контексте сопоставления различных типов вскармливания, поскольку в состав современных молочных смесей нередко включают Bifidobacterium или сложные олигосахариды, в частности ГОС, с целью частичного воспроизведения функциональных свойств ГМ. В этой связи заслуживают внимания результаты исследования N. Heppner et al., в котором показано, что детская смесь, обогащенная ГОС, способствовала сохранению высокого уровня Bifidobacterium, что согласуется и с полученными нами данными [41].
В группе ИВ основной вклад в межгрупповую дифференциацию на видовом уровне вносили Bifidobacterium longum и Akkermansia muciniphila (A. muciniphila). Последняя представляет собой хорошо изученную анаэробную бактерию, специализирующуюся на деградации муцина и ассоциированную с поддержанием здоровья человека. С учетом структурного сходства между слизистыми гликанами и свободными ОГМ особый интерес представляет способность A. muciniphila утилизировать ОГМ. В исследовании I. Kostopoulos et al. показано, что A. muciniphila способна расти на человеческом молоке и расщеплять его компоненты, представленные олигосахаридами [42]. Протеомный анализ продемонстрировал экспрессию ферментов, обеспечивающих деградацию ключевых гликанов, в т. ч. α-L-фукозидаз, β-галактозидаз, экзо-α-сиалидаз и β-N-ацетилгексозаминидаз. Указанные ферменты участвуют в расщеплении таких структур, как 2’-FL, LNT, лактоза и LNnT. Гидролиз гликанов хозяина создает условия для метаболического взаимодействия A. muciniphila с другими комменсальными микроорганизмами, что, вероятно, способствует формированию устойчивой микробной экосистемы кишечника. Таким образом, способность A. muciniphila использовать компоненты человеческого молока может обеспечивать ее выживание в кишечнике в раннем возрасте, колонизацию слизистого слоя в первые годы жизни и, как следствие, участие в поддержании барьерной функции слизистой оболочки и метаболического гомеостаза. С учетом этих данных выявление данного таксона в группе ИВ, вероятно, может быть связано с добавлением 2’-FL в состав молочной смеси, использованной в настоящем исследовании [42]. Вместе с тем в литературе представлены и дополнительные данные относительно клинического значения A. muciniphila, т. к., согласно данным L. Jiang et al. [43], у детей с ожирением по сравнению с контрольной группой отмечалось более низкое относительное содержание Akkermansia muciniphila и более высокое содержание представителей родов Ruminococcus, Agathobacter и Collinsella. И в целом было показано, что у детей с ожирением по сравнению с детьми с нормальной массой тела выявлены более низкие показатели α-разнообразия кишечной микробиоты и меньшая относительная численность доминирующих пробиотических микроорганизмов при одновременном увеличении доли родов, ассоциированных с метаболическими нарушениями, усилением воспалительных процессов и снижением интенсивности обмена веществ [43]. Bifidobacterium longum – одна из доминирующих бактерий в микробиоте младенцев, преобладала у детей на ИВ. В отношении части других микроорганизмов к третьему визиту структура межгрупповых различий существенно изменялась, что свидетельствует о различии траекторий созревания кишечной микробиоты в зависимости от типа вскармливания (рис. 4). В то же время на 3-м визите большинство микроорганизмов не было ассоциировано с конкретным типом вскармливания.
Анализ суммарной представленности семейства Bifidobacteriaceae в образцах не выявил достоверных различий между группами, при этом частота встречаемости (наличие в образце) Bifidobacteriaceae и на 1-м и на 3-м визитах была выше у детей на ИВ (рис. 5).
Рисунок 5. Суммарная представленность семейства Bifidobacteriaceae в образцах младенцев на грудном и искусственном скармливании на двух визитах
Figure 5. Bacteria contributing the most to differences between groups at Visit 3

На 1-м визите Bifidobacteriaceae выявлялись у 70,6% детей на грудном и у 83,3% детей на ИВ; к 3-му визиту частота их обнаружения увеличилась до 79,4 и 96,7% соответственно. Следовательно, доля детей без представителей данного семейства снизилась с 29,4 до 20,6% в группе ГВ и с 16,7 до 3,3% в группе ИВ. В целом Bifidobacteriaceae широко выявлялись в обеих группах, при этом более высокая частота их обнаружения отмечалась у детей на ИВ как на 1-м, так и на 3-м визите.
Сопоставление групп между собой показывает, что уже на первом визите тип вскармливания ассоциирован с различиями в составе кишечной микробиоты, однако к третьему визиту эти различия становятся более структурированными и биологически интерпретируемыми. Для детей на грудном вскармливании более характерно сохранение профиля, включающего B. bifidum, B. breve, Lacticaseibacillus paracasei и представителей рода Veillonella, что может соответствовать микробиоте, формирующейся под влиянием грудного молока и его биоактивных компонентов [44, 45]. Напротив, у детей на искусственном вскармливании к третьему визиту отмечается более выраженная представленность B. longum, A. muciniphila, Bacteroides spp. и других таксонов, ассоциированных с метаболическим разнообразием и усложнением микробной экосистемы. Следовательно, выявленные различия отражают не только вариации в наличии отдельных микроорганизмов, но и различные направления постнатального созревания кишечного микробиома [46]. Более высокая доля и частота выявления B.longum у детей на искусственном вскармливании при наличии 2’-Fl в составе смеси согласуются с данными других исследований и подтверждают бифидогенный эффект данного олигосахарида. Высокий уровень бифидобактерий рассматривается как благоприятный признак становления кишечной микробиоты и ассоциируется с многочисленными положительными эффектами для здоровья младенца [47].
ГВ представляет собой биологически согласованную детерминанту раннего постнатального формирования кишечной микробиоты. Невозможность реализации исключительно ГВ по ряду причин может быть ассоциировано с формированием альтернативных траекторий микробной колонизации, характеризующихся изменением таксономической структуры и перестройкой межмикробных взаимодействий. Выявленные различия затрагивают не только относительную численность отдельных бактериальных таксонов, но и конфигурацию микробных ассоциаций, что может отражать различные сценарии созревания кишечной экосистемы в раннем постнатальном периоде. Полученные данные также указывают на необходимость учета способа родоразрешения при анализе влияния типа вскармливания на состав кишечной микробиоты, поскольку данный фактор способен выступать значимым источником систематического смешения при межгрупповых сопоставлениях. Поэтому обнаружение у детей раннего возраста отдельных таксонов, включая Staphylococcus aureus и Clostridium perfringens, требует интерпретации в клинико-анамнестическом контексте, а не исключительно с позиций их формального отнесения к условно-патогенным микроорганизмам. Вскармливание адаптированной молочной смесью, обогащенной 2’-Fl и пребиотиками, в частности ГОС, ассоциируется с бифидогенным эффектом и снижением колонизации потенциально патогенными микроорганизмами. В связи с этим включение в состав молочных смесей отдельных компонентов ГМ следует рассматривать как перспективное направление оптимизации искусственного вскармливания, способствующее поддержанию колонизации кишечника представителями рода Bifidobacterium у детей, которые по объективным причинам не могут быть исключительно на грудном вскармливании.
Список литературы / References
- Kapourchali FR, Cresci GAM. Early-Life Gut Microbiome-The Importance of Maternal and Infant Factors in Its Establishment. Nutr Clin Pract. 2020;35(3):386–405. doi: 10.1002/ncp.10490.
- Kumbhare SV, Patangia DVV, Patil RH, Shouche YS, Patil NP. Factors influencing the gut microbiome in children: from infancy to childhood. J Biosci. 2019;44(2):49. Available at: doi: 10.1007/s12038-019-9860-z.
- Lyons KE, Ryan CA, Dempsey EM, Ross RP, Stanton C. Breast Milk, a Source of Beneficial Microbes and Associated Benefits for Infant Health. Nutrients. 2020;12(4):1039. doi: 10.3390/nu12041039.
- Williams JE, Carrothers JM, Lackey KA, Beatty NF, Brooker SL, Peterson HK et al. Strong Multivariate Relations Exist Among Milk, Oral, and Fecal Microbiomes in Mother-Infant Dyads During the First Six Months Postpartum. J Nutr. 2019;149(6):902–914. doi: 10.1093/jn/nxy299.
- Duman H, Bechelany M, Karav S. Human Milk Oligosaccharides: Decoding Their Structural Variability, Health Benefits, and the Evolution of Infant Nutrition. Nutrients. 2024;17(1):118. doi: 10.3390/nu17010118.
- Kumar H, Collado MC, Wopereis H, Salminen S, Knol J, Roeselers G. The Bifidogenic Effect Revisited-Ecology and Health Perspectives of Bifidobacterial Colonization in Early Life. Microorganisms. 2020;8(12):1855. doi: 10.3390/microorganisms8121855.
- Asadpoor M, Peeters C, Henricks PAJ, Varasteh S, Pieters RJ, Folkerts G, Braber S. Anti-Pathogenic Functions of Non-Digestible Oligosaccharides In Vitro. Nutrients. 2020;12(6):1789. doi: 10.3390/nu12061789.
- Vandenplas Y, De Greef E, Veereman G. Prebiotics in infant formula. Gut Microbes. 2014;5(6):681–687. doi: 10.4161/19490976.2014.972237.
- Abrahamse-Berkeveld M, Alles M, Franke-Beckmann E, Helm K, Knecht R, Köllges R et al. Infant formula containing galacto-and fructo-oligosaccharides and Bifidobacterium breve M-16V supports adequate growth and tolerance in healthy infants in a randomised, controlled, double-blind, prospective, multicentre study. J Nutr Sci. 2016;5:e42. doi: 10.1017/jns.2016.35.
- Wallingford JC, Neve Myers P, Barber CM. Effects of addition of 2-fucosyllactose to infant formula on growth and specific pathways of utilization by Bifidobacterium in healthy term infants. Front Nutr. 2022;9:961526. doi: 10.3389/fnut.2022.961526.
- Ma J, Li Z, Zhang W, Zhang C, Zhang Y, Mei H et al. Comparison of gut microbiota in exclusively breast-fed and formula-fed babies: a study of 91 term infants. Sci Rep. 2020;10(1):15792. doi: 10.1038/s41598-020-72635-x.
- Browne HP, Shao Y, Lawley TD. Mother-infant transmission of human microbiota. Curr Opin Microbiol. 2022;69:102173. doi: 10.1016/j.mib.2022.102173.
- Wood LF, Brown BP, Lennard K, Karaoz U, Havyarimana E, Passmore JS et al. Feeding-Related Gut Microbial Composition Associates With Peripheral T-Cell Activation and Mucosal Gene Expression in African Infants. Clin Infect Dis. 2018;67(8):1237–1246. doi: 10.1093/cid/ciy265.
- Guaraldi F, Salvatori G. Effect of breast and formula feeding on gut microbiota shaping in newborns. Front Cell Infect Microbiol. 2012;2:94. doi: 10.3389/fcimb.2012.00094.
- Riley MA, Wertz JE. Bacteriocin diversity: ecological and evolutionary perspectives. Biochimie. 2002;84(5-6):357–364. doi: 10.1016/s0300-9084(02)01421-9.
- Cascales E, Buchanan SK, Duché D, Kleanthous C, Lloubès R, Postle K et al. Colicin biology. Microbiol Mol Biol Rev. 2007;71(1):158–229. doi: 10.1128/MMBR.00036-06.
- Mégraud F, Bébéar C, Dabernat H, Delmas C. Haemophilus species in the human gastrointestinal tract. Eur J Clin Microbiol Infect Dis. 1988;7(3):437–438. doi: 10.1007/BF01962361.
- Moroishi Y, Gui J, Hoen AG, Morrison HG, Baker ER, Nadeau KC et al. The relationship between the gut microbiome and the risk of respiratory infections among newborns. Commun Med. 2022;2:87. doi: 10.1038/s43856-022-00152-1.
- Lindberg E, Nowrouzian F, Adlerberth I, Wold AE. Long-time persistence of superantigen-producing Staphylococcus aureus strains in the intestinal microflora of healthy infants. Pediatr Res. 2000;48(6):741–747. doi: 10.1203/00006450-200012000-00007.
- Raineri EJM, Maaß S, Wang M, Brushett S, Palma Medina LM, Sampol Escandell N et al. Staphylococcus aureus populations from the gut and the blood are not distinguished by virulence traits-a critical role of host barrier integrity. Microbiome. 2022;10(1):239. doi: 10.1186/s40168-022-01419-4.
- Jepsen SD, Lund A, Matwiejuk M, Andresen L, Christensen KR, Skov S. Human milk oligosaccharides regulate human macrophage polarization and activation in response to Staphylococcus aureus. Front Immunol. 2024;15:1379042. doi: 10.3389/fimmu.2024.1379042.
- Lindberg E, Adlerberth I, Hesselmar B, Saalman R, Strannegård IL, Aberg N, Wold AE. High rate of transfer of Staphylococcus aureus from parental skin to infant gut flora. J Clin Microbiol. 2004;42(2):530–534. doi: 10.1128/JCM.42.2.530-534.2004.
- Widström AM, Brimdyr K, Svensson K, Cadwell K, Nissen E. Skin-to-skin contact the first hour after birth, underlying implications and clinical practice. Acta Paediatr. 2019;108(7):1192–1204. doi: 10.1111/apa.14754.
- Lin S, Xiong Z, Zhang C, Liu S, Ding T, Yang K et al. A molecular comparative study of intestinal colonization with Staphylococcus aureus between pediatric inpatients and outpatients of different age groups. Microbiol Spectr. 2025;13(7):e0239424. doi: 10.1128/spectrum.02394-24.
- Salminen S, Endo A, Isolauri E, Scalabrin D. Early Gut Colonization With Lactobacilli and Staphylococcus in Infants: The Hygiene Hypothesis Extended. J Pediatr Gastroenterol Nutr. 2016;62(1):80–86. doi: 10.1097/MPG.0000000000000925.
- Fernández L, Pannaraj PS, Rautava S, Rodríguez JM. The Microbiota of the Human Mammary Ecosystem. Front Cell Infect Microbiol. 2020;10:586667. doi: 10.3389/fcimb.2020.586667.
- Jimenez-Truque N, Tedeschi S, Saye EJ, McKenna BD, Langdon W, Wright JP et al. Relationship between maternal and neonatal Staphylococcus aureus colonization. Pediatrics. 2012;129(5):e1252–e1259. doi: 10.1542/peds.2011-2308.
- Zhou P, Manoil D, Belibasakis GN, Kotsakis GA. Veillonellae: Beyond Bridging Species in Oral Biofilm Ecology. Front Oral Health. 2021;2:774115. doi: 10.3389/froh.2021.774115.
- Figueiredo ART, Kramer J. Cooperation and conflict within the microbiota and their effects on animal hosts. Front Ecol Evol. 2020;8:132. doi: 10.3389/fevo.2020.00132.
- Oña L, Giri S, Avermann N, Kreienbaum M, Thormann KM, Kost C. Obligate cross-feeding expands the metabolic niche of bacteria. Nat Ecol Evol. 2021;5(9):1224–1232. doi: 10.1038/s41559-021-01505-0.
- Fehr K, Moossavi S, Sbihi H, Boutin RCT, Bode L, Robertson B et al. Breastmilk Feeding Practices Are Associated with the Co-Occurrence of Bacteria in Mothers’ Milk and the Infant Gut: the CHILD Cohort Study. Cell Host Microbe. 2020;28(2):285–297.e4. doi: 10.1016/j.chom.2020.06.009.
- Guaraldi F, Salvatori G. Effect of breast and formula feeding on gut microbiota shaping in newborns. Front Cell Infect Microbiol. 2012;2:94. doi: 10.3389/fcimb.2012.00094.
- Inchingolo F, Inchingolo AD, Palumbo I, Trilli I, Guglielmo M, Mancini A et al. The Impact of Cesarean Section Delivery on Intestinal Microbiota: Mechanisms, Consequences, and Perspectives-A Systematic Review. Int J Mol Sci. 2024;25(2):1055. doi: 10.3390/ijms25021055.
- Biasucci G, Benenati B, Morelli L, Bessi E, Boehm G. Cesarean delivery may affect the early biodiversity of intestinal bacteria. J Nutr. 2008;138(9):1796S–1800S. doi: 10.1093/jn/138.9.1796S.
- Nakajima A, Arzamasov AA, Sakanaka M, Murakami R, Kozakai T, Yoshida K et al. In vitro competition with Bifidobacterium strains impairs potentially pathogenic growth of Clostridium perfringens on 2’-fucosyllactose. Gut Microbes. 2025;17(1):2478306. doi: 10.1080/19490976.2025.2478306.
- Nagpal R, Tsuji H, Takahashi T, Nomoto K, Kawashima K, Nagata S, Yamashiro Y. Gut dysbiosis following C-section instigates higher colonisation of toxigenic Clostridium perfringens in infants. Benef Microbes. 2017;8(3):353–365. doi: 10.3920/BM2016.0216.
- Mueller NT, Differding MK, Østbye T, Hoyo C, Benjamin-Neelon SE. Association of birth mode of delivery with infant faecal microbiota, potential pathobionts, and short chain fatty acids: a longitudinal study over the first year of life. BJOG. 2021;128(8):1293–1303. doi: 10.1111/1471-0528.16633.
- Qi C, Li Z, Tu H, Sun F, Guo W, Di C et al. 2’-FL and cross-feeding bifidobacteria reshaped the gut microbiota of infants with atopic dermatitis ex vivo and prevented dermatitis in mice post-microbiota transplantation through retinol metabolism activation. Gut Microbes. 2025;17(1):2474148. doi: 10.1080/19490976.2025.2474148.
- Schalich KM, Buendia MA, Kaur H, Choksi YA, Washington MK, Codreanu GS et al. A human milk oligosaccharide prevents intestinal inflammation in adulthood via modulating gut microbial metabolism. mBio. 2024;15(4):e0029824. doi: 10.1128/mbio.00298-24.
- Duranti S, Lugli GA, Mancabelli L, Armanini F, Turroni F, James K et al. Maternal inheritance of bifidobacterial communities and bifidophages in infants through vertical transmission. Microbiome. 2017;5(1):66. doi: 10.1186/s40168-017-0282-6.
- Heppner N, Reitmeier S, Heddes M, Merino MV, Schwartz L, Dietrich A et al. Diurnal rhythmicity of infant fecal microbiota and metabolites: A randomized controlled interventional trial with infant formula. Cell Host Microbe. 2024;32(4):573–587.e5. doi: 10.1016/j.chom.2024.02.015.
- Kostopoulos I, Elzinga J, Ottman N, Klievink JT, Blijenberg B, Aalvink S et al. Akkermansia muciniphila uses human milk oligosaccharides to thrive in the early life conditions in vitro. Sci Rep. 2020;10(1):14330. doi: 10.1038/s41598-020-71113-8.
- Jiang LF, Wang YY, Peng H, Li R, Zhang F, Wang N et al. Association between obesity with the diversity and genus of gut microbiota in school-aged children. Zhonghua Liu Xing Bing Xue Za Zhi. 2022;43(2):260–268. doi: 10.3760/cma.j.cn112338-20210617-00478.
- Saturio S, Nogacka AM, Alvarado-Jasso GM, Salazar N, de Los Reyes-Gavilán CG, Gueimonde M, Arboleya S. Role of Bifidobacteria on Infant Health. Microorganisms. 2021;9(12):2415. doi: 10.3390/microorganisms9122415.
- Lordan C, Roche AK, Delsing D, Nauta A, Groeneveld A, MacSharry J et al. Linking human milk oligosaccharide metabolism and early life gut microbiota: bifidobacteria and beyond. Microbiol Mol Biol Rev. 2024;88(1):e0009423. doi: 10.1128/mmbr.00094-23.
- Kammara R, Nellikka A. Acquiring bifidobacteria species from formula-fed and breast-fed newborns: identifying, quantifying and creating an antibiogram. Access Microbiol. 2023;5(8):acmi000590.v3. doi: 10.1099/acmi.0.000590.v3.
- Holst AQ, Myers P, Rodríguez-García P, Hermes GDA, Melsaether C, Baker A et al. Infant Formula Supplemented with Five Human Milk Oligosaccharides Shifts the Fecal Microbiome of Formula-Fed Infants Closer to That of Breastfed Infants. Nutrients. 2023;15(14):3087. doi: 10.3390/nu15143087.